Een ogenschijnlijk klein verhaal ontvouwt zich tot een mysterieuze wereld van experimenten en verborgen samenlevingen, tot leven gebracht met rijke, gedetailleerde animatie.
 

De film volgt Mrs. Brisby, een weduwe-muis die wanhopig een manier zoekt om haar zieke zoon te redden terwijl het veld wordt omgeploegd. Haar zoektocht leidt naar een mysterieuze kolonie ratten, met wie ze een onverwachte band blijkt te hebben—een geheim dat teruggaat naar experimenten van het instituut NIMH.

Als regiedebuut van Don Bluth—die samen met andere animators Disney verliet om dit project te realiseren—valt de film op door zijn gedurfde, soms duistere stijl en expressieve animatie. Met gloeiende ogen, dreigende schaduwen en fantasierijke decors creëert The Secret of NIMH een wereld die zowel betoverend als beklemmend aanvoelt—een invloedrijke klassieker die laat zien hoe ver animatie kan gaan buiten de gebaande paden.